结尊仁达瓦是宗喀巴大师所有上师中，对大师影响最大、最深远的无比恩师，因此大师奉他为“根本上师”。有一次，当结尊仁达瓦抵达前藏时，大师前往迎接，见面献上“哈达”后，立刻再呈上偈颂，赞叹结尊仁达瓦。云：

　　“无可思大悲藏眼观视，无垢智主师利微妙音，无余群队魔灭唯密主，雪岭胜贤顶严仁达瓦，宣奴罗追莲足下祈祷。”

　　结尊仁达瓦看，谦让未遑地说：“我无此德，不敢当，这一偈颂你倒可当之而无愧。”于是结尊仁达瓦将原颂末后二句更易人名，改成赞叹宗喀巴大师。颂云:

　　“无可思大悲藏眼观视，无垢智主师利微妙音，无余群队魔灭唯密主，雪岭胜贤顶严宗喀巴，善慧称扬莲足下祈祷。”

　　后来大师的弟子，又请示大师是否能以此颂赞叹他，经大师许可后，乃根据此颂造祈祷文之仪轨。

　　这偈颂的意义，可分显意和密意两方面来讲。显意方面：第一句是赞叹大悲藏观世音菩萨的功德，第二句是赞叹空慧聚文殊师利菩萨的功德，第三句是赞叹密主金刚手菩萨的功德，第四句是说圣宗喀巴大师具足三尊菩萨之所有功德，第五句是说持诵的人在大师的足下祈祷。

　　密意方面：

　　(1) 外喻相。是说观世音菩萨(莲华部)、文殊师利菩萨(佛部)、金刚手菩萨(金刚部)等三位部主，在一切佛会上，以及一切菩萨中，一位代表最特殊之悲心，一位代表最特殊之智慧，一位代表最特殊之神力。而宗喀巴大师在末法时代，于南瞻部洲建树佛法，所依靠的就是这三种特殊的功德。如今请求圣宗喀巴大师加持，令我也能同样具足这三种功德。

　　(2) 内证功德。十方诸佛所具有的悲心，观世音菩萨全部具足；十方诸佛所具有的智慧，文殊师利菩萨全部具足，十方诸佛所具有的神力，金刚手菩萨全部具足。而宗喀巴大师又具足这三位菩萨所有的悲、智、力等功德。如今请求圣宗喀巴大师加持，令我也能同样具足这三种功德。

　　(3) 秘密本尊。由十方诸佛之大悲心所示现的色相，就是观世音菩萨，并非离诸佛之外而别有观世音菩萨；由十方诸佛之大智所示现的色相，就是文殊师利菩萨，并非离诸佛之外而别有文殊师利菩萨；由十方诸佛之大神力所示现的色相，就是金刚手菩萨，并非离诸佛之外而别有金刚手菩萨。而宗喀巴大师又是三位菩萨所共同示现，所以十方诸佛及观世音、文殊师利、金刚手等菩萨，就是我宗喀巴大师；宗喀巴大师与十方诸佛及观世音、文殊师利、金刚手等菩萨，是一非二。如今请求宗喀巴大师加持，令我也能同样成就如是功德。

　　此五句颂系三部主合一之陀罗尼，又是宗喀巴大师自己所造。修持这祈祷颂，即总括智、仁、勇三位本尊的一切功德，所以感应特别快速，不但能广开智慧，而且尚能降诸魔障。

　　过去西藏有一位大喇嘛，在雪山中修行时，山前有一户人家，正遭受贝哈尔魔的作祟。这户人家因不堪其扰，遂延请许多高人前来驱治，但都没有效果。有一天，村中有一位牧童无意中来到大喇嘛修行的地方，于是将村中所发生的事情告诉了大喇嘛。大喇嘛听了，送给牧童一双加持过的鞋子，和一串加持过的念珠；并吩咐他，当魔进入屋子时，将鞋子放在大门的两旁，念珠则散置在四面墙壁空隙的地方。当天晚上，牧童见魔进入被害者的屋子后，立即遵照大喇嘛所指示的方法去做。刹那间，贝哈尔魔看到自己的四周，布满了无量金刚护法神，大门口又有金刚手菩萨守护着，因此感到非常惶恐。这时，大喇嘛已随之而至，贝哈尔魔遂跪求大喇嘛，请喇嘛放他一条生路。大喇嘛回答说：“放你可以，不过你必须遵守我的约定。”大喇嘛要贝哈尔魔以后遵守不再扰人的戒律，但魔以祟人为生，如果今后不再扰人，必定断其生路，因此不肯。大喇嘛要贝哈尔魔今后不扰乱诵“宗喀巴大师祈祷文”的人，他也不肯。因为康藏地方，几乎没有人不诵此颂，如果遵守此戒律，就和遵守今后不再扰人的戒律一样。最后大喇嘛要他遵守不扰乱诵“宗喀巴大师祈祷文”一百零八遍的人的戒律，贝哈尔魔这才欣然答应。

　　贝哈尔魔非常凶猛，威力无比，此魔不敢为祟，其他的魔就更不用说了。西藏地方，修行人若稍有上进，或将成就，贝哈尔魔必乘隙为祟，因此“宗喀巴大师祈祷文”遍行于康藏中。凡修持“宗喀巴大师祈祷文” 的人，都能得到宗喀巴大师的特别加持，消除一切魔障，圆满福慧资粮，快速成就佛道。