一般艾叶是没有什么副作用的，但是对于过敏的人，还是不建议使用的。

　　长期使用艾叶，如果挥发油(香味成分)使用过多，对神经会有抑制，能损害肝脏、中枢神经、血管，导致中毒性肝炎。艾叶油能明显抑制离体蟾蜍心脏的收缩，对心率的影响不大，但可引起房室传导阻滞，浓度加大可使心搏停止。

　　野艾煎剂可兴奋家兔离体子宫，产生强直性收缩；粗制浸膏对豚鼠离体子宫亦有明显兴奋作用，孕妇慎用。

　　毒性：艾叶油小鼠灌胃LD50为2.47ml/kg，腹腔注射为1.12ml/kg。艾叶所含挥发油对皮肤有轻度刺激作用，引起发热潮红，口服能刺激胃肠道分泌，口服干艾叶3-5g可增进食欲，但大剂量可引起胃肠道急性炎症，产生大量恶心呕吐，若大量吸收后可引起中枢神经系统过度兴奋，出现谵妄、惊厥及肝损害等。由于神经反射性的变化，以及血管壁本身受损，可招致子宫充血、出血，妊娠时甚至流产。