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别传禅寺文脉论学
群峰羅列似兒孫 高坐丹霞一寺尊
定力能經桑海換 叢林尚有典型存
一爐柏子參禪味 七盌松濤覓夢痕
未得徧行堂集看 願將片語鎮山門
——原中国佛协会长赵朴初一九八六年
首赴丹霞山别传禅寺参拜时赋诗
别传禅寺作为佛门丛林，不仅刹竿高树，更摄儒道，与中国文化的脉络相贯相通。
开法祖师天然和尚出家前以孝廉出仕；开山祖师澹归和尚出家前以举进士出仕，皆是明末名儒。
寺院初成时建有斗母殿，康熙三十六年（1697年）建雪岩石室供奉关帝、吕祖。由此，构成了别传禅寺儒、道、佛和融共存的独特文化奇观。别传禅寺与其祖庭番禺海云寺（毁于抗日战争）形成了清初岭表文化活动的中心。对其后岭南文化的发展产生了重大的影响。
以天然、澹归、屈大均、廖燕为核心，一南一北两个寺院，一个在珠江头，一个在珠江尾，两相呼应形成了清初珠江流域的一个文化聚合中心，诞生了“海云诗派”和“海云书派”，为一时之文化盛举。
经中山大学仇江先生整理，有关别传禅寺的文献著作目录如下：
（明）道独：
1、《长庆宗宝独禅师语录》六卷（金陵刻经处本）
2、《华严宝镜》一卷（顺治海幢经坊重刻本）
3、《长庆语录》二卷（清海幢经坊重刻本）
（清）函罡天然：
1、《瞎堂诗集》十二卷（道光海幢经坊重刻本）
2、《天然和尚梅花诗》四卷（康熙写刻本）
3、《丹霞天老人雪诗》四卷（清刻本）
4、《首楞严直指》十卷（扬州刻经处本）
5、《楞伽心印》四卷（雍正海幢经坊本）
6、《般若心经论》一卷（日本《续藏经》第一辑）
7、《天然禅师语录》十二卷（台湾版明代《大藏经》）
8、《天然和尚同住训略》一卷（清写刻本）
（清）今释澹归：
1、《徧行堂集》四十九卷目录二卷（乾隆五年刻本）
2、《徧行堂续集》十六卷（乾隆五年刻本）
3、《岭海焚馀》（江苏广陵古籍刻印社，一九八一年版）
4、《澹归和尚日记手稿》（澳门普济禅院藏）
5、《元功垂范》（清刻本）
（清）函可：
1、《千山诗集》二十卷首一卷补遗一卷（康熙廿九年写黄华寺
重刻本）
2、《千山剩人和尚语录》六卷（康熙廿九年写黄华寺重刻本）
（清）今无阿字：
1、《光宣台集》二十五卷（清刻本）
2、《海幢阿字无禅师语录》二卷（嘉庆二十四年重刊本）
（清）成鹫：
《咸陟堂集》诗十七卷，文二十五卷（康熙乙丑刻本）
（清）徐作霖、黄蠡：
《海云禅藻集》（民国廿四年版，逸社丛书之一）
（清）袁枚：
《游丹霞记》（《小方壶斋与地从钞》第四帙，上海著易堂版一八九一
年）
（清）恽敬：
《经丹霞山记》（《小方壶斋与地从钞》第四帙，上海著易堂版一八九
一年）
（清）刘湘客：
《行在阳秋》（《明季稗史初编》卷十一，岳麓书社一九八二年版）
（清）计六奇：
《假山图五虎号》（《明季南略》卷十二，中华书局一九八四年版）
(清)王夫之：
《金堡传》（《永历实录》卷二十一，岳麓书社一九八二年
版）
(清)陈世英：
《丹霞山志》十卷（雍正十一年别传寺刻本）
(清)邵廷采：
《金堡传》（《西南纪事》卷七）
(清)温睿临：
《金堡传》（《南疆驿史刊本列传》卷十九）
(清)全祖望：
《鲒埼亭集 外编 卷廿九》（上海商务印书馆）
(清)叶亭琯：
1、《性因上书定南王事》（《鸥陂渔话》卷二，清刻本）
2、《记（徧行堂集）事》（《鸥陂渔话》卷二，清刻本）
邹鲁：
《游丹霞记》（《仁化县志 卷首》民国二十三年出版）
容肇祖：
《（遍行堂集）残本跋》（《中大语言历史研究所周刊》第七十
二期 民国十八年》）
孙翼民：
《重修丹霞山志》（民初稿本）有缺失
朱希祖：
《康熙本（遍行堂集）跋》(《明季史料题跋》)
汪宗衍：
1、《天然和尚年措》(民国癸未铅印本)
2、《（遍行堂集）跋》
3、《明末剩人和尚年谱（台湾商务印书馆，民国七十五年版）
陈垣：
《清初僧诤记》（民国二十三年《励耘富屋丛刻》本）
仁化县政府：
《丹霞游览册》（民国三十三年）
北平故宫博物院文献馆：
《澹归和尚（徧行堂集）案》（《清代字狱档第三辑》，上海
书店一九八六年）
陈荆鸿：
1、《天然和尚以名孝廉作名僧》（《艺文丛稿》香港一九
九三年）
2、《澹归和尚开宗仁化丹霞寺》（《艺文丛稿》香港一九
九三年）
吴天任：
《澹归禅师年谱》（香港铅印本一九八八年）
姜伯勤：
1、《澹归与（徧行堂集）》（四库禁毁书丛刊编委会征集
论文，一九九九年）
2、《石濂大汕舆澳门禅史》（学林出版社一九九九年）
蔡鸿生：
《清初岭南佛门事略》（广东高教出版社，一九九七年）
龙思谋：
《丹霞山诗文词》（广东高教一九九七年）
朱万章：
《岭南金石书法论丛》（文化艺术出版社，二００一年）
廖肇亨：
《金堡之节义观舆历史评价探析》（《中国文哲研究通讯》第
九卷第四期）
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