①噶举派玛巴传米拉日巴的密教大手印是明空两点二合一论，显教大手印是唯空性论，只有空的一面，所以还要结合显教的大悲心四无量心，缘起观等等来达到双运。
　　但《土观宗派源流》中说噶举派的见在玛米二人时是应成派的空性见。并引了道歌中一段话说“一切诸法都是假名安立，空无自性”这是应成派的唯空性一点论。但是仔细研究《道歌》不是唯空性一点论而是明空两点合一论。如：“心之自性为明空，直指明空即妙光”《道歌》265页)又说：“我承洛扎玛巴上师为我直指说，一切诸法皆是自心，我亦如实悟到那自心就是明空之性”(《道歌》207页)。又说〃“其实心的本来就是空寂光明(明空)，若能证悟此点则是成佛”(《道歌》551页)。有的法师批评他不懂经典，他回答说：“你的这些经典(文字)我不会，我是以心为学习，所以外境显现均为经典，与显境不分离就是与经典不分离，显境的老师告诉我，外显诸境即是自心，自心即是明空”(《道歌》536页)。总之《道歌》中提明空之处甚多可的为证。明空之见噶举派与宁玛派相同，噶举名大手印，宁玛名大圆满都不是中观应成派，他们都主张有自心本性。冈布瓦受噶当派《道次第》的影响提出显教大印，为适应三根普被，把顿悟顿修的法门变成为渐修渐悟的法门。他以后的弟子，又受他的影响，提出很多显密结合修大印的导引。由于各自的风规不同，噶举派门中遂裂为若干小派。后来冈布瓦的弟子噶玛巴提出的大手印又是明空两点合一论，于是噶举的《大印》又与《大圆满》合而为一了。
　　空明两点合一论，实际包括了风心、心物二者对立的统一观。不过他们提的色心二点，不是象小乘所说色心各有自性，常恒不变的二元论，而是色心二者皆无自性，不然何以能够双融不二(二合为一)。这双融的统一体，就是众生的心，就是佛性，大手印名如来藏，大圆满名大菩提心。
　　②既悟明空了，空是体，明是用，明属气分能化现，故三身本具在明空之中。宁玛派说悟了明空，只有保任，三身自然显发，法尔本然，不须用功用去别修报化，虽修亦不成。噶举派认为三身固然是本具，但悟明空还有层次，低层次的对佛的智德不易显发，不能不采取密乘的方便，来强制成佛，所以要别修报化身。就是为了解决佛心和佛身的矛盾问题。尤其是要即身成佛，对身和心这个主要矛盾，就必须进行解决不可，换言之用《那若六法》密乘大手印在本元心体上转成大乐体性的本元身，是化粗身为最细身，这样的身心结合为一，才能现证三身而成佛。
　　③噶举派提出“身”的概念来，本来佛教忌说“身”的，因为凡夫的我执就是由执身而起，不过显教说的身仍指此四大五蕴和合的质碍之身，噶举派提出的本元身，是属气，属物的，就胜义说心和物一切皆空无自性，就世俗说，身和心，风和心，心和物从宇宙一开始就有两种相对存在，但两种是结合在一起的，它们都不是恒存的，不然各守自性，则不能结合在一起了。
　　④关于“风心”问题本元身是最微细的风，它从无始以来乃至成佛未曾断绝，是无始本具，与本元心同时存在。心是精神因素，风(气)是物质因素，精神和物质也即是说无始以来，心和物二者是结合在一起的，不能分开。不过，不管是精神或物质他们都不承认有自性，若有自性，则各自独立，不能结合在一起了，因此心物是互相终始的，有心在，就有身在。他们提出悟心外还要修身，其理由就是身是风，解决心的问题，还要解决风的问题，而且风心之中的风往往起主导作用，即使要悟明空之心，但众生身(气)上还存在着根本无明，贪嗔烦恼八十自性分别，都是最微细的风存在身的内最深隐处，若不通过密乘方便，难于断除。无明是生死流转的根本，无明不断，出不了轮回，悟心无用，并且风是障碍佛的三身显发的，即使悟明空也悟不彻底。《俱舍论》说风是情器世界的安排者，风(气)是业气的负荷者，最难转变。吾人身心往往不能自主，大多由风不能自主，修风脉瑜伽就是求得风(气)心自在，佛是风(气)心得自在者，所以才能出现报化，神通自在。在修行中往往出现心理上难于排除的障碍，也是由于风息引起，妄念流动亦是受风的鼓动。风是宇宙的根本动力，风是很重要的，修密是修身，也即是使修风脉明点和转粗风成微细风的问题。统一身心，也就是统一风心，使风心成为无别。风心既属本有，成佛亦不能消灭，只是转业风为智风而已。从上看来他们说“风心”是不承认宇宙最终元素为单独精神因素，而是心物合一论。
　　⑤关于幻身理论的特色。幻身的基础是本元身，本元身实质是清澄的微细的风(气分)，在凡夫粗身阶段时它隐藏得很深不易见到，它是生命的任持者。本元身既为本具，当然不能完全隐秘，必有显露之时机，抓着显露之时来认识光明幻身这是《六法》的中心思想。时机分为四时机，或五时机。一、睡眠时梦中出现四空最后之身为习气身；二、临终时四空最后出现之身为中阴身；三、入无色定(79)，住三摩地，不现身根，但有潜伏的微细身，这是带业识之身，业报完后，仍沦入他趣，不能超出轮回。四、在修拙火时用远离瑜伽的强制办法出现四空心，由微细风而起现报化身，此则名为幻身。这四种身都是同一品类，作为修习幻身的依据。故六法中有抓梦境，入光明定等成就法。若是即身不能成就，为对治生死中有，所以六法中又有中阴成就和迁识成就法，中阴成就法也是修幻身的方法。迁识法则借佛力将微细风心迁入佛心或他方净土，可以保证不入轮回的办法。所谓不修成佛法，这有点像类似内地的禅净双修。幻身是风心结合的产物，当然这种风是已净化了的智风，而不是业风，但也是缘生法，缘起无性，由于色心已得自在，可以任意变化，故幻身有如幻化亦非究竟真实，佛的二种色身即报化身也是变化的，犹如幻身。所以就胜义说，一切诸法皆无自性，性空，这是唯一的；就世俗说，色心二法是缘起相对而有，虽有如幻。缘起是承认两点，成佛两点则统于一点，二合为一，消除差别，达到平等圆融境地。以上这就是《大手印》的双运之义，也是噶举派的中心教义。