作為世界文化與自然遺產的峨眉山，藏有大量的寶貴文物，僅就全山有史可稽的第一座佛寺萬年寺來說，除了擁有全國重點文物保護單位宋代普賢騎象銅像、省級文物保護單位明代無梁磚殿以外，另有「佛門三寶」供奉在普賢行願樓。也許還有人不知道吧？
　　一是上古佛牙。這枚長四十二．六六公分、重六．五公斤的「佛牙」，光潤如玉，於金黃色中透出紫色條紋。據我國古脊椎動物學家揚鍾健教授鑒定，認為它是二十萬年前我國南方劍齒象的牙化石，只因是宋代僧人從佛國斯里蘭卡帶回來的，僧人故以「佛牙」的美稱，來表達他們崇佛的心理。
　　二是萬曆金印。長寬各十三公分，正中籌刻「普賢願王之寶」六字，上方刻楷體「大明萬曆」，左邊刻「禦題磚殿」，右邊刻「敕賜峨山」。明代穆宗朱載厚的孝定李皇后，年輕時久未生育，曾經派人到峨眉山白水普賢寺（今萬年寺）宋代普賢騎象銅像進香求嗣，許願若懷男嬰，定為菩薩穿金，重修廟宇。不久，李皇后懷孕了，生下朱翊鈞，被立為太子。萬曆元年，朱翊鈞登基為神宗，尊號其母為「慈聖皇太后」。他們母子對普賢菩薩的感激之情異乎尋常，不時賞賜白水普賢寺。寺下方曾經有座小巧的慈聖庵，就是專門用來存放慈聖太后和萬曆皇帝賜品的，而今改建為客舍了。萬曆二十七年（一五九九年），白水普賢寺罩護普賢銅像的木閣毀於大火。次年，慈聖太后賜金重修，僧人台泉仿印度熱那寺建無梁磚殿庇護銅像，於一六○一年七月竣工。適逢慈聖太后六十大壽，神宗親自題額「聖壽萬年寺」，從此該寺改名為萬年寺，同時還賜了這顆禦印。因是帝王賞賜，雖為銅質僧人亦尊稱為金印。
　　三是梵文貝葉經。長五十公分，寬十二．五公分。以泥金書寫梵文《華嚴經》於黝黑色的貝多羅樹葉上，共二百四十六頁。在造紙術未發明前，古印度僧人常用此樹葉漚水後晾乾書寫佛經。梵語稱這種樹葉為「貝多羅」，故稱貝葉經。大量貝葉經從印度和斯里蘭卡傳入我國和東南亞一帶，對佛教文化的傳播起了很大的推動作用。古典詩詞對聯中，常常用「貝葉」代指佛教經書。明代萬曆十九年（一五九一年），峨眉山無窮禪師、性寬禪師赴京師，請求皇室資助修建峨眉大佛寺。慈聖太后欣然發帑金，並將印度僧人進貢的這冊貝葉經轉賜無窮禪師。峨眉大佛寺成於一六○五年，後毀，這部珍貴的貝葉經遂由萬年寺收藏。